《꽃 피는 해적선》은 봄꽃을 모르는 해적 가족이 할머니의 생신을 기억하기 위해 봄꽃을 키우면서 일어나는 이야기를 담고 있다. 봄꽃을 구하기 위해 작은 꽃 가게로 간 해적 가족은 꽃집 아주머니의 도움으로 꽃씨를 키우는 방법을 배우게 되는데…